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Experimental Hematology & Oncology | 临港实验室合作揭示三氧化二砷介导靶向降解ALK的新机制2026-08-03近日，临港实验室陆文超团队联合同济大学杨静团队、张文君团队等，在Experimental Hematology & Oncology发表题为“Arsenic trioxide promotes a glue-like interaction to drive STUB1-mediated NPM-ALK degradation in ALK+ ALCL”的研究论文。该研究发现，ATO能够促进E3泛素连接酶STUB1与NPM-ALK的相互作用，进而诱导NPM-ALK泛素化降解，为ATO干预ALK阳性ALCL提供了新的机制解释。 间变性大细胞淋巴瘤（Anaplastic large cell lymphoma, ALCL）是一类侵袭性T细胞淋巴瘤。其中，ALK阳性ALCL常由NPM-ALK融合蛋白驱动，NPM-ALK持续激活ALK及其下游信号通路，是该类肿瘤发生发展的关键致癌蛋白。尽管化疗和ALK酪氨酸激酶抑制剂在部分患者中能够取得较好疗效，但复发和耐药仍是临床治疗中的重要挑战。 三氧化二砷（Arsenic trioxide, ATO）作为经典老药，已在急性早幼粒细胞白血病（APL）治疗中展现出明确疗效。既往研究提示，ATO也能够降低NPM-ALK蛋白水平并抑制ALK阳性ALCL生长，但... -
Nature Communications丨临港实验室合作发现减重手术通过促进一碳代谢改善MASH的新机制2026-07-31近日，临港实验室臧奕团队联合复旦大学附属华山医院，中国科学院上海药物研究所在Nature Communications发表研究论文“Bariatric surgery resolves MASH by enhancing MAT1A-dependent one-carbon metabolism”，揭示减重手术通过激活MAT1A依赖的一碳代谢通路，促进肝脏代谢重塑并改善MASH的新机制，为理解代谢手术的长期获益机制以及发展精准干预策略提供了新的理论依据。 代谢功能障碍相关脂肪性肝炎（MASH）是代谢功能障碍相关脂肪性肝病（MASLD）的进展阶段，可表现为肝细胞气球样变、炎症和纤维化，并可能进一步发展为肝硬化、肝细胞癌甚至终末期肝衰竭。减重手术是目前获得持久体重下降和代谢改善的有效手段之一。其中，垂直袖状胃切除术（VSG）不仅能减重，还常在明显体重下降之前就带来血糖等代谢指标的改善。然而，临床观察发现，不同患者接受手术后肝脏获益存在明显差异：部分患者即使实现显著体重下降，肝脏炎症和纤维化仍未得到充分改善，提示VSG手术存在非减重依赖... -
Angewandte Chemie | 临港实验室合作发现首个WBP4高选择性分子胶降解剂并开发新型靶标验证系统2026-07-30近日，临港实验室陆文超团队联合武汉大学蒋白山团队及烟台大学芦静团队，在Angewandte Chemie International Edition上发表了题为“Selective and Potent First-in-Class CRBN-Dependent Molecular Glue Degraders of WW Domain-Binding Protein 4”的研究论文。该研究不仅成功发现了高活性、高选择性的CRBN依赖型WBP4分子胶降解剂 dWBP4-1，还将该蛋白的互作机制创新性地转化为一种精简、高效的新一代化学生物学工具——wTAG系统。 靶向蛋白降解（Targeted Protein Degradation, TPD），尤其是分子胶降解剂（Molecular Glue Degraders, MGDs），为攻克传统“不可成药”靶点提供了强大的新策略。WW结构域结合蛋白4（WBP4）是一种与RNA剪接体相关的支架蛋白。由于其结构高度无序且缺乏深邃的疏水结合口袋，WBP4是典型的小分子难靶向蛋白。然而，最新研究表明，分子胶这一新兴的药物形式能够通过靶向 G-loop 区域降解传统方法无法成药的靶点，为这类难靶蛋白带来了新的破局机遇。 近日，临港实验室陆文超团队联合武汉大学蒋白山团队... -
Nature Methods | 临港实验室魏武团队建立大视野单细胞分辨率全长空间转录组技术Fullscope-seq，助力神经系统疾病机制研究2026-07-242026年7月24日，临港实验室魏武团队在Nature Methods发表研究论文Full-length single-cell spatial transcriptomics reveals spatial and cell-type-specific transcript isoforms in the primate brain，建立大视野、单细胞分辨率全长空间转录组技术Fullscope-seq，并首次在灵长类大脑开展单细胞全长空间转录组分析。 大脑由高度多样化的细胞类型和精细复杂的空间结构构成。同一基因可通过选择不同的转录起始位点、可变剪接方式及转录终止位点，产生结构与功能各异的转录本异构体。不同异构体可能编码具有不同蛋白结构、亚细胞定位和生物学功能的产物，是调控神经发育、突触功能和神经环路活动的重要分子基础；其异常表达或使用失衡也与自闭症谱系障碍、精神分裂症、双相情感障碍及其他神经系统疾病密切相关。现有空间转录组多依赖短读长测序或预设探针，难以同时获得完整转录本结构、单细胞定位和厘米级组织视野。 ... -
GeneClaw 联手智慧芽：打通全球研发情报，打造生物医药技能矩阵2026-03-203月20日，GeneClaw迎来重要能力升级——正式接入智慧芽（PatSnap）的专利检索与新药情报API，具备了从"自然语言提问"到"专业情报报告"的端到端交付能力。用户只需用一句话描述需求，GeneClaw即可自主调用全球专利与新药数据、结合生物医学知识进行深度分析，将原本数小时的情报调研工作压缩至分钟级。 3月9日，临港实验室自主研发的 AI 科学智能体GeneClaw在内部上线，迅速引发科研人员的高度关注与活跃试用；3月12日正式对外发布后，短短一周内收获众多用户关注与合作意向。一、GeneClaw是什么？GeneClaw是临港实验室打造的企业级科学智能体，深度面向生物医药研发场景，内置300+经专业验证的技能包，覆盖从靶点发现、管线情报到组学分析、化合物SAR的完整研发链路。基于云端沙箱架构运行，安全可控，用户侧对话即用，无需任何本地安装与配置，轻松融入现有科研工作流。3月20日，GeneClaw迎来重要能力升级——正式... -
Nature Machine Intelligence | 临港实验室合作构建AI驱动的肿瘤序贯治疗新策略，揭示表观药物增敏肿瘤治疗新机制2026-03-16黄洵团队与同济大学刘琦教授团队合作，聚焦抗肿瘤序贯治疗展开系统探索。近期在Nature Machine Intelligence期刊上发表论文，发布了结合肿瘤虚拟细胞和强化学习的序贯用药理性设计框架——SequenTx。该框架将序贯治疗设计为基于细胞状态演化的序贯决策问题，通过构建虚拟细胞(AIVC)模拟药物扰动下肿瘤细胞的变化，并结合强化学习进行策略优化，实现对药物序贯应用的系统性推演与方案筛选。在此基础上通过多维度实验揭示了表观药物处理诱导肿瘤细胞进入易感状态，进而增敏后续化疗的药物治疗新机制。 表观遗传异常是各类肿瘤的共性特征，但表观遗传抗肿瘤药物在应用中普遍面临疗效受限的困境，其症结在于：表观遗传调控本质上是伴随染色质重塑和转录重编程的动态演化过程，而当前的用药模式却大多停留在持续抑制靶点活性的静态逻辑中。从药理学视角审视，药物干预从来不是单行道——其在抑制靶点酶活的同时，必然触发细胞层面的代偿性响应，这些药物诱导的状态变化既是药效的延伸，更是治疗耐受的基础。因此，将该类药物治疗思路从持续压制转向动态调控转变，或可成为突破表观药物实体瘤疗效瓶颈的关键。... -
GeneClaw元生龙虾发布!2026-03-122026年3月12日，临港实验室元生AI团队正式发布GeneClaw——面向生物医药研发场景深度定制的企业级科学智能体。GeneClaw基于实验室自主研发的元生 OriGene 智能体与开源框架OpenClaw 构建，由临港实验室内部科学家与AI工程师联合打造，内置300+经过专业验证的生物医药技能包，涵盖靶点发现、管线情报、组学数据分析、化合物SAR分析等研发场景。 2026年3月12日，临港实验室元生AI团队正式发布GeneClaw——面向生物医药研发场景深度定制的企业级科学智能体。 GeneClaw基于实验室自主研发的元生 OriGene 智能体与开源框架OpenClaw 构建，由临港实验室内部科学家与AI工程师联合打造，内置300+经过专业验证的生物医药技能包，涵盖靶点发现、管线情报、组学数据分析、化合物SAR分析等研发场景。 针对龙虾“养殖”环节存在的安全风险，GeneClaw采用云端隔离沙箱架构，全程无需本地安装、不接入办公内网、不进行内外网穿透，从底层架构上实现... -
Journal of Clinical Investigation | 临港实验室合作构建胆囊癌肝侵犯空间细胞图谱，揭示胆囊癌与肝脏交界处的免疫细胞的动态特征2026-03-032026年3月2日，临港实验室魏武研究团队与上海交通大学刘颖斌、李茂岚、邵荣团队、香港大学万钧团队联合在Journal of Clinical Investigation期刊上发表了题为“Macrophage-rich niches regulate T cell dynamics at the liver invasive margin during gallbladder cancer progression”的研究论文。该研究整合单细胞转录组与空间转录组技术，系统绘制了胆囊癌肝侵犯微环境的细胞图谱，首次识别肝脏侵犯交界区域特有的免疫生态位结构，揭示了CXCL9+巨噬细胞与LGALS4+肿瘤细胞在调控CD8+T细胞“招募—增殖—耗竭”动... 胆囊癌是胆道系统中最具侵袭性的恶性肿瘤之一，其易发生直接肝侵犯的特性是导致手术难度高、预后不良的关键原因。尽管肝侵犯在临床中极为常见，但肿瘤—肝脏交界处微环境的细胞组成、空间架构及免疫调控机制仍不明确。近年来，单细胞转录组技术为解析肿瘤异质性提供了强大工具，而空间转录组学更进一步揭示了细胞在组织中的原位分布与互作关系。然而，在胆囊癌肝侵犯这一动态界面中，免疫细胞的空间组织规律及其功能调节机制仍有待系统揭示。 2026年3月2日，临港实验室魏武研究团队与上海交通大学... -
Neuron | 让大脑“看见”！临港实验室合作建立百万通道光遗传脑机接口2026-02-042026年2月3日，临港实验室李昊团队与中国科学院脑智卓越创新中心刘真研究组合作，在神经生物学顶级学术期刊《Neuron》在线发表了题为“A mesoscale optogenetics system for precise and robust stimulation of the primate cortex”的研究论文。研究团队成功建立了基于介观光遗传技术的新型超高通道数脑机接口，攻克了对灵长类大脑皮层长期、精准、稳定刺激的技术难题，为脑机接口和脑科学研究领域带来了重要突破。 2026年2月3日，临港实验室李昊团队与中国科学院脑智卓越创新中心刘真研究组合作，在神经生物学顶级学术期刊《Neuron》在线发表了题为“A mesoscale optogenetics system for precise and robust stimulation of the primate cortex”的研究论文。研究团队成功建立了基于介观光遗传技术的新型超高通道数脑机接口，攻克了对灵长类大脑皮层长期、精准、稳定刺激的技术难题，为脑机接口和脑科学研究领域带来了重要突破。 向大脑精准稳定地“写入”信息是高性能脑机接口的核心挑战。然而，现有技术在灵... -
临港实验室首发通用式分子设计世界模型ODesign，实现核酸、蛋白质、小分子等多形态分子的统一设计2025-10-272025年10月27日，由临港实验室牵头，联合上海人工智能实验室、香港中文大学、上海交通大学、浙江大学、华盛顿大学、哈佛大学等合作机构，共同发布国际首个通用分子设计世界模型——ODesign。该模型允许科学家在任意类型靶标上指定目标位点，并以精准可控的方式实现蛋白质、多肽、核酸、小分子及金属离子等多类型生物配体的一键式设计。在多个行业标准测试集上，ODesign显著优于RFDiffusion、BindCraft等主流单形态分子设计模型，标志着生成式 AI药物研发从“单点突破”迈向“通用智能”的关键跨越。 继诺奖团队开发的AlphaFold3和RFDiffusion-AA横空出世后，通用式生物分子结构预测已达到令人惊叹的精度，为AI赋能药物研发领域打下了坚实基础。在药物研发漫长的研发环节中，通用式生物分子设计是下一个AI赋能药物研发领域的“圣杯”。 2025年10月27日，由临港实验室牵头，联合上海人工智能实验室、香港中文大学、上海交通大学、浙江大学、华盛顿大学、哈佛大学等合作机构，共同发布国际首个通用分子设计世界模型——ODesign。该模型允许科学家在任意类型靶标上指定目标位点，并以精准可控的方式实现...
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