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Nature Machine Intelligence | 临港实验室合作构建AI驱动的肿瘤序贯治疗新策略，揭示表观药物增敏肿瘤治疗新机制2026-03-16黄洵团队与同济大学刘琦教授团队合作，聚焦抗肿瘤序贯治疗展开系统探索。近期在Nature Machine Intelligence期刊上发表论文，发布了结合肿瘤虚拟细胞和强化学习的序贯用药理性设计框架——SequenTx。该框架将序贯治疗设计为基于细胞状态演化的序贯决策问题，通过构建虚拟细胞(AIVC)模拟药物扰动下肿瘤细胞的变化，并结合强化学习进行策略优化，实现对药物序贯应用的系统性推演与方案筛选。在此基础上通过多维度实验揭示了表观药物处理诱导肿瘤细胞进入易感状态，进而增敏后续化疗的药物治疗新机制。 表观遗传异常是各类肿瘤的共性特征，但表观遗传抗肿瘤药物在应用中普遍面临疗效受限的困境，其症结在于：表观遗传调控本质上是伴随染色质重塑和转录重编程的动态演化过程，而当前的用药模式却大多停留在持续抑制靶点活性的静态逻辑中。从药理学视角审视，药物干预从来不是单行道——其在抑制靶点酶活的同时，必然触发细胞层面的代偿性响应，这些药物诱导的状态变化既是药效的延伸，更是治疗耐受的基础。因此，将该类药物治疗思路从持续压制转向动态调控转变，或可成为突破表观药物实体瘤疗效瓶颈的关键。... -
Journal of Clinical Investigation | 临港实验室合作构建胆囊癌肝侵犯空间细胞图谱，揭示胆囊癌与肝脏交界处的免疫细胞的动态特征2026-03-032026年3月2日，临港实验室魏武研究团队与上海交通大学刘颖斌、李茂岚、邵荣团队、香港大学万钧团队联合在Journal of Clinical Investigation期刊上发表了题为“Macrophage-rich niches regulate T cell dynamics at the liver invasive margin during gallbladder cancer progression”的研究论文。该研究整合单细胞转录组与空间转录组技术，系统绘制了胆囊癌肝侵犯微环境的细胞图谱，首次识别肝脏侵犯交界区域特有的免疫生态位结构，揭示了CXCL9+巨噬细胞与LGALS4+肿瘤细胞在调控CD8+T细胞“招募—增殖—耗竭”动... 胆囊癌是胆道系统中最具侵袭性的恶性肿瘤之一，其易发生直接肝侵犯的特性是导致手术难度高、预后不良的关键原因。尽管肝侵犯在临床中极为常见，但肿瘤—肝脏交界处微环境的细胞组成、空间架构及免疫调控机制仍不明确。近年来，单细胞转录组技术为解析肿瘤异质性提供了强大工具，而空间转录组学更进一步揭示了细胞在组织中的原位分布与互作关系。然而，在胆囊癌肝侵犯这一动态界面中，免疫细胞的空间组织规律及其功能调节机制仍有待系统揭示。 2026年3月2日，临港实验室魏武研究团队与上海交通大学... -
Neuron | 让大脑“看见”！临港实验室合作建立百万通道光遗传脑机接口2026-02-042026年2月3日，临港实验室李昊团队与中国科学院脑智卓越创新中心刘真研究组合作，在神经生物学顶级学术期刊《Neuron》在线发表了题为“A mesoscale optogenetics system for precise and robust stimulation of the primate cortex”的研究论文。研究团队成功建立了基于介观光遗传技术的新型超高通道数脑机接口，攻克了对灵长类大脑皮层长期、精准、稳定刺激的技术难题，为脑机接口和脑科学研究领域带来了重要突破。 2026年2月3日，临港实验室李昊团队与中国科学院脑智卓越创新中心刘真研究组合作，在神经生物学顶级学术期刊《Neuron》在线发表了题为“A mesoscale optogenetics system for precise and robust stimulation of the primate cortex”的研究论文。研究团队成功建立了基于介观光遗传技术的新型超高通道数脑机接口，攻克了对灵长类大脑皮层长期、精准、稳定刺激的技术难题，为脑机接口和脑科学研究领域带来了重要突破。 向大脑精准稳定地“写入”信息是高性能脑机接口的核心挑战。然而，现有技术在灵... -
临港实验室首发通用式分子设计世界模型ODesign，实现核酸、蛋白质、小分子等多形态分子的统一设计2025-10-272025年10月27日，由临港实验室牵头，联合上海人工智能实验室、香港中文大学、上海交通大学、浙江大学、华盛顿大学、哈佛大学等合作机构，共同发布国际首个通用分子设计世界模型——ODesign。该模型允许科学家在任意类型靶标上指定目标位点，并以精准可控的方式实现蛋白质、多肽、核酸、小分子及金属离子等多类型生物配体的一键式设计。在多个行业标准测试集上，ODesign显著优于RFDiffusion、BindCraft等主流单形态分子设计模型，标志着生成式 AI药物研发从“单点突破”迈向“通用智能”的关键跨越。 继诺奖团队开发的AlphaFold3和RFDiffusion-AA横空出世后，通用式生物分子结构预测已达到令人惊叹的精度，为AI赋能药物研发领域打下了坚实基础。在药物研发漫长的研发环节中，通用式生物分子设计是下一个AI赋能药物研发领域的“圣杯”。 2025年10月27日，由临港实验室牵头，联合上海人工智能实验室、香港中文大学、上海交通大学、浙江大学、华盛顿大学、哈佛大学等合作机构，共同发布国际首个通用分子设计世界模型——ODesign。该模型允许科学家在任意类型靶标上指定目标位点，并以精准可控的方式实现... -
临港实验室合作提出去甲肾上腺素转运体构象选择性变构调控模型，为抗抑郁药物的研发开辟了新路径2025-10-242025年10月24日，临港实验室蒋轶研究员团队联合中国科学院上海药物研究所徐华强研究员、杨德华研究员团队，以及临港实验室王震研究员团队，在《Cell》上在线发表了题为“Unveiling conformation-selectivity regulation of the norepinephrine transporter”的研究论文。该研究鉴定出NET内向开放构象特异性的变构位点，提出了靶向该构象的阻断剂识别新机制——“瓣膜模型”。基于该模型，研究团队采用“干–湿”结合的研究策略，发现了具有体内外抗抑郁活性的小分子，并通过结构药理学手段阐明了其结合模式。该... 去甲肾上腺素转运体（norepinephrine transporter，NET）是单胺转运体家族的重要成员，负责再摄取大脑突触间隙的去甲肾上腺素和多巴胺，与血清素转运体及多巴胺转运体共同维持突触单胺类神经递质的稳态。NET在调节情绪、注意力及应激反应中发挥关键作用，是治疗重度抑郁症和注意缺陷多动障碍等神经精神疾病的重要药物靶点。然而，NET如何被不同药物精准调控，尤其是其构象选择性与变构调控机制，仍有待深入阐明。 继在《Nature》（2024）上首次揭示NET同源二聚化机制及抗抑郁药物识别机制后，2025... -
Advanced Functional Materials | 临港实验室构建肿瘤靶向脂质体共载NFS1抑制剂和顺铂改善耐药结直肠癌治疗效果2025-10-162025年10月16日，临港实验室郎天群团队联合王锦政团队在国际学术期刊Advanced Functional Materials上发表题为“Inhibiting NFS1 by Targeting Liposomes for Combating Cisplatin-resistant Colorectal Cancer”的研究论文。该研究构建了一种D18多肽修饰的脂质体（DLP），该脂质体共负载顺铂和半胱氨酸脱硫酶抑制剂以实现结直肠肿瘤靶向递药并有效杀伤耐药肿瘤。 结直肠癌（CRC）在全球癌症中发病率排名第三，死亡率排名第二，严重危害人类健康。目前，化疗仍是CRC切除术后的主要治疗手段，代表性药物包括顺铂（CP）和奥沙利铂等铂类药物。然而，多种耐药机制导致CRC对CP治疗的化疗敏感性降低，进而加大药量引起全身系统性毒性。因此，克服铂类药物耐药，同时最大限度地减少全身毒性仍是临床CRC治疗亟待解决的难题。联合用药为克服肿瘤耐药提供了一种有效策略。半胱氨酸脱硫酶（NFS1）抑制剂（NI）可通过抑制NFS1活性来放大氧化应激，有效触发肿瘤细胞发生泛凋亡（PAN... -
Advanced Science | 临港实验室合作发现高效靶向TEAD降解剂2025-10-062025年10月5日，临港实验室陆文超团队联合烟台大学药学院赵克浩团队及同济大学杨静团队在 Advanced Science 期刊发表了题为“Discovery of a Potent and Selective TEAD Degrader with Durable Degradation Activity”的研究论文，报道了高效TEAD降解剂 KG-FP-003在胸膜间皮瘤及其他相关疾病中的潜在治疗作用。研究的部分成果已于2025年在美国癌症研究学会年会（AACR）以 Late-Breaking Poster 形式展示（Cancer Res. 2025, 85(8_Supplement_2): LB438）。 TEAD家族是Hippo信号通路中的关键转录因子，能与YAP/TAZ协同调控细胞的增殖与分化。大量研究表明，YAP/TAZ–TEAD复合物的异常激活与多种恶性肿瘤的发生和进展密切相关，尤其在肝细胞癌、肺癌及部分乳腺癌中表现突出。目前，传统的小分子抑制剂主要通过阻断YAP/TAZ与TEAD的相互作用发挥作用，但在选择性、耐药性及持续抑制方面仍存在挑战。相比之下，基于蛋白降解的新型策略（如PROTAC技术）通过直接诱导TEAD蛋白的选择性降解，从源头上抑制致癌信号通路，有望实现更高效、更持久的治疗效果。 2025... -
新型元对齐算法Meta-AlignNN助力实现稳定的脑机接口解码2025-09-10临港实验室李澄宇团队的邹勇杰、何振亮、管寿梁和中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心的学生刘锴等同志提出了一种名为“Meta-AlignNN”的元学习框架。旨在实现跨时间、跨个体、跨任务的持久稳定解码性能。该方法的核心思想在于，尽管单个神经元的活动易变，但控制运动行为的群体神经活动的潜在动态模式具有高度保守性。Meta-AlignNN通过一个“元对齐器”，学习将不同来源的不稳定神经活动映射到一个统一、稳健的潜在表征空间中，再由一个固定的解码器进行解析，从而实现了脑机接口解码算法的快速自适应。 脑机接口的临床应用长期面临着一大核心瓶颈：神经信号的不稳定性。这种不稳定性体现在：神经活动不仅随时间推移而产生漂移，还在不同个体和不同任务间存在巨大差异。导致脑机接口系统需要频繁重新校准，极大限制了实用性。 为突破这一挑战，临港实验室李澄宇团队的邹勇杰、何振亮、管寿梁和中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心的学生刘锴等同志提出了一种名为“Meta-AlignNN”的元学习框架。旨在实现跨时间、跨个体、跨任务的持久稳定解码性能。该方法的核心思想在于，尽管单个神经元的活动易... -
Molecular Cell丨临港实验室通过相分离凝聚体的活细胞成像揭示TEAD抑制剂作用新机制，开启药物评估与发现新范式2025-09-112025年9月5日，临港实验室朱光亚研究团队，联合上海科技大学谢菁菁课题组、上海交通大学医学院附属上海儿童医学中心潘秋辉课题组以及上海奕拓医药朱继东团队，在Molecular Cell 期刊发表最新研究成果，题为“Endogenous YAP/TAZ partitioning in TEAD condensates orchestrates the Hippo response”。该研究首次揭示了TEAD核内凝聚体作为空间组织中心的功能，并进一步建立了基于凝聚体的活细胞药效评价体系，为TEAD靶向药物的开发提供了全新路径。 转录因子TEAD是Hippo信号通路的核心节点，广泛参与肿瘤发生及免疫治疗耐药。近年来，TEAD被认为是YAP/TAZ驱动癌症的重要“下游开关”，因此成为抗肿瘤药物研发的关键靶点。多家跨国药企已布局TEAD抑制剂的临床开发，其中包括阻断 YAP–TEAD 蛋白互作的抑制剂（如 IAG933），以及靶向TEAD中央口袋的抑制剂（如 SW-682、VT3989）。然而，目前学界对TEAD及其与YAP/TAZ复合物的调控机制仍认识不足，这限制了TEAD抑制剂的深入开发和机制研究。 2025年9月5日，临港实验室朱光亚研究团队，联合上海科技大... -
Trends In Biochemical Sciences | 临港实验室合作研究：探索稳定蛋白-蛋白相互作用的非降解型分子胶2025-08-22近日，临港实验室陆文超团队联合华东理工大学张健教授在Cell Press旗下期刊Trends in Biochemical Sciences在线发表“Exploring non-degrading molecular glues for protein-protein interactions”的综述文章。 该综述系统总结了非降解型分子胶的作用机制和研究进展，重点介绍了FKBP12、环孢素A和14-3-3等经典“呈递蛋白”体系，同时结合新兴案例展示了该领域的快速发展。作者强调，化学生物学、结构生物学与计算辅助设计等学科的深度融合，正在推动非降解型分子胶的加速发现与应用。 蛋白质-蛋白质相互作用（PPIs）构成了细胞生命活动的基本网络，是信号传导、转录调控、代谢控制等过程的关键环节。长期以来，PPIs 被认为是“难以成药”的领域：其作用界面通常平坦且缺乏明确的小分子结合口袋，传统抑制剂开发面临巨大挑战。然而，随着靶向蛋白降解（TPD）策略的兴起，研究者们发现可以通过“化学邻近诱导”（chemical induced proximity）的方式来重塑或诱导特定的蛋白-蛋白相互作用，从而突破 PPI 成药性的传统限制。 近年来，基于E3连接酶的分子胶降解剂（MGDs）推动了TPD领域...
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